提摩太前後書都有主題，是長執及教會的管理人的手冊及管理結構。第一章提及長執要有信仰的清晰及把握，不被異端邪說所影響。第二章有簡單中心，長執首要的工作便是祈禱、守望、代求的工作。
教會有三重結構，第一重為信徒大眾，第二重為執事（協助牧師及長老完成管理及領導的責任），第三重為牧師及長老。如果當中沒有領導及被領導的關係及觀念，教會便很難組織及發展工作，甚至在重大的事情上便很難作決定。所以，教會必須有對教會有承擔的人擔任長老。於舊約，神興起領袖摩西，但單有摩西一人做領導及審判官，使摩西疲於奔命，幸好有摩西的岳丈提點摩西要在群眾中，選立七十個長老作為第一層的核心領導，後來再立千夫長、百夫長、五十夫長及十夫長等，在各分層管理群眾。新約及今天教會則有牧師、長老及執事作領導。
保羅勸提摩太第一首要的事，是為萬人懇求、禱告、代求及祝謝。教會無論長老、長執及會眾也好，也要重視禱告的工作，為自己、教會、特別是在上掌權的不斷禱告，因為神可以按其心意改變君王的心，如同攪動隴溝的水一樣，好讓教會及信徒使我們可以敬虔端正、平安無事的度日，並且使在上掌權的做合乎真理的決定。保羅並說這樣特別為君王祈禱是好事，因為這是救主悅納的事，祂願意萬人得救，明白真道。
於2:8，保羅特別提到男人要舉起聖潔的手、隨處禱告。男人如果着重祈禱，便可以使生命無忿怒及爭論，而且男人作為教會及家庭之首，祈禱可使教會及家庭和睦。於2:9-11，保羅願女人廉恥、自守、以正派衣裳為妝飾、不以編髮、黃金、珍珠、和貴價的衣裳為妝飾及炫耀，並要學習順服的功課。今天教會可以在長老的授權下，女人亦可以講道及教導的工作，但同時亦要學習順服及沉靜。
但願教會無論長老、長執及會眾也重視祈禱的工作，使教會興旺，榮耀神的名。
